GGP

O chip GGP nellore consiste em 35.090 SNPs que são selecionados otimamente para raças Bos indicus utilizando o software SelectSNP que possui uma otimização MOLO (Wu et al., 2016). O chip também inclui SNPs Bos indicus específicos para testes de parentesco e ensaios causais de doenças genéticas.

O painel de SNP Bos indicus 35K possui:

  • SNP alvos de espinha dorsal específico para raça multi- nellore 19K, altamente informativos de acordo com o MAF ponderado
  • SNPs 3K, altamente informativos (MAF específico de raça > 0,40), especificamente para Brahman e Nellore, respetivamente
  • SNPs 2K, altamente informativos (MAF específico de raça > 0,40), especificamente para Guzzera e Gyr, respectivamente
  • SNPs 3K, altamente informativos (MAF específico de raça > 0,40), especificamente para DroughtMaster, Santa Gertrudis e Tropical Composites, respectivamente
  • Um conjunto adicional de 1000 SNPs de mapa ideal (escolhidos para preencher os espaços cromossômicos)
  • A precisão da imputação (para o Illumina Bovine HD) é média de mais de 97% de todas as raças avaliadas

Informação técnica