Neogen® oferece uma gama de soluções genômicas para pequisa e desenvolvimento utilizando tecnologias de genotipagem/sequenciação de catálogo e personalizadas. GeneSeek® tem mais de 18 anos de experiência em pesquisa genômica utilizando populações de camundongos, animais de produção e animais de companhia através de muitas espécies de plantas.

Gado

As operações de GeneSeek da Neogen estão na vanguarda da genômica e os testes genéticos do gado. GeneSeek é o fornecedor exclusivo de soluções de teste de ADN para touros de gado leiteiro para IA e a maioria das associações de criação de raça pura.

GeneSeek Genomic Profilers™ (GGP) é o padrão ouro internacional para testes de desempenho em gado de leite devido ao seu conteúdo personalizado e design inovador.

GGP Bovine 50K

O GGP Bovine 50K aproveita o processo de seleção de SNP líder da Neogen para escolher com precisão os melhores 50,000 marcadores SNP para oferecer uma avaliação mais precisa do mérito genético, a seleção do genoma completo, estudos de genética comparativa e maior imputação de densidade.

GGP Bovine 150K

O GGP Bovine 150K conta com mais de 150,000 SNPs para a predição mais precisa dos animais reprodutores de elite disponíveis no mercado de hoje.

GGP Bovine F-250

A nova oferta para a descoberta em bovinos é o GeneSeek Genomic Profiler F-250 (GGP F-250). O array foi desenvolvido juntamente com a Universidad de Missouri e outros colaboradores, o chip para genotipagem GGP F-250 utiliza a química de Illumina Infinium e tem quase 200,000 SNPs para a avalição precisa de variantes funcionais tais como mutações não-sinônimos, de deslocamento da estrutura e de terminação prematura. Outros 35,000 ensaios SNPs estrategicamente selecionados estão incluidos, o que permite aos pesquisadores a capacidad de investigar o mérito genético, aplicar a seleção do genoma completo e a capacidade de imputar com precisão arrays de maior densidad.

Animais de Estimação

CanineHD BeadChip

O laboratório GeneSeek da Neogen é líder no fornecimento de testes com a tecnologia Illumina BeadChip. O array CanineHD BeadChip é um teste ideal para os pesquisadores que investigam o genoma canino. Os dados coletados desta pesquisa podem ser usados para fornecer informação sobre a saúde canina, bem como fornecer informação sobre a herança de doenças humanas importantes.

O CanineHD BeadChip oferece um conteúdo de SNP altamente polimórfico que fornece uma cobertura genômica uniforme ideal para estudos de associação do genoma completo (GWAS), determinação do mérito genético, identificação de loci de características quantitativas (QTL) e estudos de genética comparativa em cualquer raça. Este BeadChip foi criado através do esforço do consórcio LUPA, uma iniciativa dedicada a utilizar o genoma canino para desvendar transtornos complexos em humanos e cães. O CanineHD BeadChip, que funciona com a química do Illumina Infinium, contém mais de 170,000 marcadores com uma média de mais de 70 marcadores por megabase (Mb). O BeadChip está em processo de atualização e em breve incluirá cerca de 225,000 SNPs.

Teste de parentesco por ADN

O teste de parentesco por ADN canino é utilizado para confirmar as relações familiares entre pais e filhos. Os criadores e donos de cães utilizam este teste para garantir a precisão dos registros de reprodução, confirmar e garantir pedigrees, e proteger a integridade da raça. Mais informações podem ser encontradas aquí.

Array Feline 63K

O array de ADN felino Illumina Infinium iSelect 63K foi lançado para o uso em Fevereiro de 2011 pela Morris Animal Foundation para uso de pesquisadores que realizam GWAS e estudos baseados em arrays. Na pendência da aprovação de projetos de pesquisa por Morris Animal Foundation, o laboratório GeneSeek de Neogen é capaz de processar amostras nesta plataforma.

Painéis e arrays personalizados

O laboratório de operações GeneSeek de Neogen tem desenvolvido painéis personalizados para pesquisa e uso comercial que tem sido bem sucedido em todo o mundo. Nós estamos especializados na genotipagem de alto rendimiento com resposta rápida e nossos especialistas estarão felizes em ajudá-lo a selecionar a plataforma de teste apropriada para atender às suas necessidades. Se as opções de chip para genotipagem padrão não são apropriadas para seus objetivos específicos, os laboratórios GeneSeek também oferecem os arrays personalizados Illumina Infinium BeadChips e Affymetrix Axiom, bem como painéis de seleção assistida por marcadores menos densos. Os ensaios podem ser adaptados às necessidades específicas de genotipagem de regiões específicas, estudos de validação, estudos de associação ou programas de reprodução assistida por marcadores. Também oferecemos bioinformática, relatórios eletrônicos e um equipo de serviço ao cliente experiente para traduzir os dados colectados em informações prácticas e úteis.

Os ensaios personalizaos para genotipagem de GeneSeek:

  • Apenas 500 amostras
  • Capacidade de amostra para centenas de milhares
  • Escolha entre 1-600,000 ensaios de SNP
  • Várias espêcies no mesmo chip
  • Taxas médias de sucesso genotípico > 99%

Equinos

GeneSeek Genomic Profiler (GGP) Equine SNP70 BeadChip

O GGP Equine SNP70 BeadChip está disponível na GeneSeek. O BeadChip para a genotipagem de SNPs equinos é baseada na plataforma do Illumina Infinium e é uma das soluções mais completas disponíveis para a genotipagem do genoma completo. Este BeadChip melhorado, de segunda geração apresenta mais de 65,000 SNPs distribuídos de forma equitativa derivados da coleção de SNPs EquCab2.0. O BeadChip para equinos é uma ferramenta poderosa que permite a identificação de genes e polimorfismos que contribuem para traços de interesse em todas as grandes raças de cavalos.

Affymetrix Equine HD array

O array HD para equinos Affymetrix de 670,000 SNP foi projetado após a triagem de mais de 2 milhões de SNPs abrangendo o genoma equino. Fornece uma cobertura genômica ótima da diversidade genética conhecida entre raças de cavalos domésticos, maximizando a utilidade da pesquisa em genética equina, incluindo estudos de associação do genoma completo, mapeamento de alta resolução, mapeamento Mendeliano de traços, análise de diversidade e análise de seleção de assinatura.

SynchroGait

SynchroGait é um teste de DNA de diagnóstico baseado em um projeto de pesquisa que identificou uma variante genética que tem um grande impacto na marcha e coordenação de cavalos. O teste SynchroGait permite-lhe identificar um dos fatores genéticos mais importantes que afetam o desempenho de um cavalo de trote e que é permissivo para marcha alternativa, como a dos cavalos islandeses. É utilizada para prever a técnica e o talento do trote entre os cavalos utilizados para as corridas de chicotes e talento para diferentes caminhos entre certas raças de cavalos utilizados para a equitação.

Painéis e arrays personalizados para equinos

O sistema de deteção baseado em espectrometria Agena MassARRAY para genotipos sensíveis, precisos e rápidos

  • O software de otimização e análise de ensaios multiplexado fáceis de usar, economiza tempo de pequisa e ajuda a maximizar a eficiência
  • Os números flexíveis de SNPs permitem a seleção assistida por marcador econômico
  • Teste de parentesco

Camundongo

O Giga Array Universal de Genotipagem de Camundongos (GigaMUGA) fornece mais de 143,000 marcadores SNP construídos na plataforma Illumina Infinium. O GigaMUGA melhora os 78,000 SNPs do MegaMUGA e inclui quase todo o conteúdo do antecessor. A maioria dos marcadores SNP estão distribuídos ao longo do genoma do camundongo e foram selecionados para ser informativos na maioria das populações de camundongos, incluindo camundongos selvagens e múltiplas espécies de Mus, mas com ênfase especial para os marcadores que são informativos nos recursos de população de camundongos Collaborative Cross e Diversity Outbred.

Plantas

GeneSeek ofrece opções extensivas para a genotipagem de plantas. GeneSeek pode fazer genotipagem por sequenciação (GBS), bem como a descoberta SNPs para projetos de genotipagem de plantas de todos os tamanhos e espécies. Com esta informação de sequenciação, GeneSeek pode ajudar no desenvolvimento de ferramentas de genotipagem personalizadas adaptadas às suas necessidades precisas de conteúdos genômico de diferentes plantas. Oferecemos serviços para cada etapa de melhoria genômica para uma planta de interesse.

Nossos serviços incluem:

  • Sequenciação para a descoberta de SNPs
  • Bioinformática para selecionar os melhores SNPs para estudos de associação do genoma completo
  • Construção de arrays de SNPs de média ou alta densidade para criar modelos genômicos
  • Construção de arrays e painéis de baixa densidade para a seleção assistida por marcadores
  • Uso de ferramentas de diagnóstico para identificar resistência de linhas susceptíveis

Sequenciamento

Genotipo direcionado por sequenciamento

GeneSeek utiliza tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS) de ADN para genotipo efetivo em alvos específicos; centenas a milhares de marcadores genéticos podem ser identificados de forma rápida e económica em grandes populações usando a tecnologia de genotipagem por sequenciamento (GBS) AmpliSeq™. Os produtos de GeneSeek incluem design de ensaio de sequenciamento personalizado focado, PCR de enriquecimento multiplexado, sequenciação e identificação de variantes.

Sequenciamento metagenômico

Descubra a diversidade filogênica da microbiota. A tecnologia de sequenciação de próxima geração pode ser utilizada para explorar comunidades microbianas completas sem a necessidade de cultivo. Várias regiões do gene ARNr 16S podem ser examinadas para a identificação/classificação bacteriana.

Ovelha e cabra

Os testes de ADN em ovelhas podem ser utilizados para verificar o parentesco, ajudar a detectar mutações indesejáveis e a tomar decisões de reprodução apropriadas para o rebanho. Os testes genômicos usando tecnologias baseadas em chips também podem ser usados para desenvolver predições genômicas e valores de reprodução genéticamente melhorados.

As soluções de testes genômicos da GeneSeek para ovelhas incluem:

  • Mutações genéticas recessivas e causais
  • Seleção do genoma completo
  • Determinação do mérito genético
  • Identificação de loci de características quantitativas (QTL)
  • Estudos comparativos de genética

OvineSNP50 BeadChip para genotipagem

O array OvineSNP50 BeadChip apresenta mais de 54,241 sondas uniformemente espaçadas que visam SNPs, oferecendo uma densidade de SNP mais que suficiente para estudos de associação do genoma completo e outras aplicações como seleção do genoma completo, determinação do mérito genético, identificação de loci de características quantitativas e estudos de genética comparativa. O OvineSNP50 BeadChip fornece uma cobertura uniforme do genoma completo con uma média de 46kb.

Array OvineHD

O array OvineHD inclui mais de 600,000 variantes genômicas projetadas pelo Consórcio Internacional do Genoma Ovino (ISGC). O array inclui quase todo o conteúdo do array original OvineSNP50. Este array de maior densidade aumentará drasticamente o poder de identificar os principais genes responsáveis pelas características medidas desejadas.

OvineLD BeadChip

O chip OvineLD inclui aproximadamente 15,000 SNPs e é usado para imputar com precisão até os arrays para ovinos de maior densidad. Além disso, o chip também contém muitos outros conteúdos SNPs genéticos recessivos e causais.

GoatSNP50 BeadChip

O chip GoatSNP50 utiliza mais de 50,000 variantes de SNPs para fornecer coberturas genômicas uniformes. O array foi desenvolvido pelo Consórcio Internacional do Genoma Caprino, que avaliu os dados de sequenciação do genoma nas seguintes raças de cabras: Alpine, Boer, Creole, Katjang, Saanen e Savanna. Um total de 10 raças foram utilizadas para validar o conteúdo de 52k SNPs.

Outros testes genéticos de ovelhas disponíveis:

  • Susceptibilidade ao vírus de pneumoia progressiva ovina (OPPV)
  • Susceptibilidade a scrapie
  • Síndrome da aranha em ovinos
  • Miostatina
  • Parentesco por SNP

Painéis e arrays personalizados em ovelhas e cabras

Crie arrays adaptados às suas necessidades específicas para a genotipagem de regiões específicas, estudos de validação, estudos de associação ou programas de reprodução assistida por marcadores. GeneSeek oferece os arrays personalizados Illumina Infinium BeadChips e Affymetrix Axiom, bem como painéis de seleção assistida por marcadores menos densos.

Suínos

GGP para suínos

Desenvolvido através de colaborações entre cientistas corporativos y acadêmicos, o GeneSeek Genomic Profiler (GGP) para porcinos inclui os 34,000 SNPs mais informativos do Porcine60K, elimina os 20,000 SNPs que não tiveram a melhor utilidade (baixo nível de informatividade) nas grande raças comerciais e inclui uns 17,000 SNPs adicionais para preencher as lacunas do cromossomo e fornecer uma melhor cobertura. É importante notar que o chip GGP também inclui muito mais SNPs nas regiões telomere do cromossomo para explicar melhor a recombinação que pode acontecer. O GGP Porcine BeadChip também inclui vários marcadores genéticos que podem afetar diretamente a doenças e traços de desempenho.

PorcineSNP60 BeadChip

O chip PorcineSNP60 apresenta mais de 65,000 sondas uniformemente espaçadas, oferecendo uma densidade de SNP mais do que suficiente para estudos de associação do genoma completo, determinação do mérito genético, identificação de loci de características quantitativas e estudos de genética comparativos.

Affymetrix Axiom, array para genotipagem de suínos

A genotipagem por array para suínos Axiom está disponível em um formato de 96 arrays e inclui 658,692 marcadores descobertos utilizando dados da sequência do genoma completo de 210 animais que abarcam uma ampla gama de raças de suínos comerciais e não comerciais que foram selecionados por sua relevância em programas de reprodução mundial. O array de alta densidade oferece o poder e a resolução para uma ampla gama de aplicações na reprodução de suínos e genômica que incluem o estudo de associação marcador-traço, avaliação de linhas puras, identificação de populações de referência de múltiplas linhas, bem como aplicações de pesquisa para o análise genômico e estudos de análise de varredura seletiva.

SeekGain™, programa de testes para traços de desempenho em suínos de GeneSeek

GeneSeek oferece testes validados de marcadores de ADN para traços de desempenho em suínos utilizando informação de sete genes únicos que afetam:

  • Alimentação e conversão
  • Ganho de peso
  • Crescimiento magro
  • Conteúdo de gordura
  • Qualidade da carne
  • Tamanho da camada (receptor de estrogênio)
  • Tamanho da camada (eritropoyetina)

Painéis e arrays personalizados para suínos

Se as ofertas de chip para genotipagem não forem apropriadas para seus objetivos de pesquisa específicos, os laboratórios GeneSeek também oferecem os arrays personalizados Illumina Infinium BeadChips e Affymetrix Axiom. Crie ensaios adaptados às suas necessidades específicas para a genotipagem de regiões específicas, estudos de validação, estudos de associação ou programas de reprodução assistida por marcadores.

Ensaios para genotipagem personalizada de GeneSeek:

  • Apenas 1,000 muestras
  • Capacidade de amostras para centenas de milhares
  • Escolha entre 1,000 a 600,000 ensaios de SNP
  • Várias espécies no mesmo chip
  • Taxas médias de sucesso genotípico > 99%

Painéis e arrays personalizados

Crie arrays adaptados às suas necessidades específicas para a genotipagem de regiões específicas, estudos de validação, estudos de associação ou programas de reprodução assistidos por marcadores. GeneSeek oferece os arrays personalizados Illumina Infinium BeadChips e Affymetrix Axiom, bem como painéis de seleção assistida por marcadores menos densos.