Lab mouse

El Giga Array Universal de Genotipificación de Ratones (GigaMUGA) proporciona más de 143,000 marcadores SNP construidos en la plataforma de Illumina Infinium. El GigaMUGA mejora los 78,000 SNPs del MegaMUGA e incluye casi todo el contenido del predecesor. La mayoría de los marcadores SNP están distribuidos a lo largo del genoma del ratón y fueron seleccionados para ser informativos en la mayoría de las poblaciones de ratones, incluyendo ratones salvajes y múltiples especies de Mus, pero con un énfasis especial para los marcadores que son informativos en los recursos de población de ratones Collaborative Cross y Diversity Outbred. La utilización de estos SNPs informativos hacen del array una herramienta altamente rentable para muchas aplicaciones de genotipificación. Los criterios de diseño del GigaMUGa hacen que sea óptimo para detectar regiones heterocigóticas y discriminar entre haplotipos en regiones homocigóticas.

El GigaMUGA incluye un exceso de sondas en las regiones teloméricas de cada autosoma para facilitar la detección de eventos de recombinación en todo el cromosoma. Más de 46,000 SNPs fueron seleccionados específicamente para flanquear un catálogo de más de 20,000 hotspots de recombinación. El array también incluye más de 2000 sondas no SNP destinadas a explorar la variación en el número de copias en regiones seleccionadas de datos previamente publicados.

*El contenido y el diseño de GigaMUGA se realizaron en la Universidad de Carolina del Norte en Chapel Hill bajo la supervisión de Fernando Pardo-Manuel de Villena y Leonard McMillan.

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