Neogen® ofrece una gama de soluciones genómicas para la investigación y desarrollo que utilizan tecnologías de genotipado/secuenciación tanto de catálogo como personalizadas. GeneSeek® tiene más de 18 años de experiencia en investigaciones genómicas utilizando poblaciones de ratones, animales de producción y animales de compañía hasta muchas especies de plantas.

Ganado

Las operaciones GeneSeek de Neogen están a la vanguardia de la genómica y las pruebas genéticas del ganado. GeneSeek es el proveedor exclusivo de soluciones de prueba de ADN para toros sementales de ganado lechero para IA y para una mayoría de las asociaciones de criadores de razas registradas de ganado.

Los GeneSeek Genomic Profilers™ (GGP) son el estándar de oro internacional para las pruebas de rendimiento del ganado lechero debido a su contenido personalizado y diseño innovador.

GGP Bovine 50K

El GGP Bovine 50K aprovecha el proceso de selección de SNP líder de Neogen para elegir con precisión los mejores 50,000 marcadores SNP para ofrecer una evaluación más precisa del mérito genético, la selección del genoma completo, estudios de genética comparativa y la imputación de densidad más alta.

GGP Bovine 150K

El GGP Bovine 150K cuenta con más de 150,000 SNPs para la predicción más precisa de los animales reproductores de elite disponibles en el mercado de hoy.

GGP Bovine F-250

La nueva oferta para el descubrimiento en bovinos es el GeneSeek Genomic Profiler F-250 (GGP F-250). El array fue desarrollado en conjunto con la Universidad de Missouri y otros colaboradores, el chip para genotipado GGP F-250 utiliza la química de Illumina Infinium y cuenta con casi 200,000 SNPs para la evaluación precisa de variantes funcionales tales como mutaciones no-sinónimas, de desplazamiento de marco y de terminación prematura. Se incluyen unos ensayos adicionales de 35,000 SNPs estratégicamente seleccionados que permiten a los investigadores la capacidad de investigar el mérito genético, aplicar la selección del genoma completo y la capacidad de imputar con precisión arrays de mayor densidad.

Animales de compañía

CanineHD BeadChip

El laboratorio GeneSeek de Neogen es líder en el suministro de pruebas con la tecnología Illumina BeadChip. El array CanineHD BeadChip es una prueba ideal para los investigadores estudiando el genoma canino. Los datos recolectados de esta investigación se pueden utilizar para proporcionar información sobre la salud canina, así como proporcionar información sobre la herencia de enfermedades humanas importantes.

El CanineHD BeadChip ofrece un contenido de SNP altamente polimórficos que proporciona una cobertura genómica uniforme ideal para estudios de asociación del genoma completo (GWAS), determinación del mérito genético, identificación de loci de carácter cuantitativo (QTL) y estudios de genética comparativa en cualquier raza. Este BeadChip fue creado a través del esfuerzo del consorcio LUPA, una iniciativa dedicada a utilizar el genoma canino para descifrar trastornos complejos tanto en humanos como en perros. El CanineHD, que funciona con la química del Illumina Infinium, contiene actualmente más de 170,000 marcadores con un promedio de más de 70 marcadores por megabase (Mb). El BeadChip está en proceso de actualización y pronto incluirá cerca de 225,000 SNPs.

Prueba de parentesco por ADN

La prueba de parentesco por ADN canino se utiliza para confirmar las relaciones familiares entre padres e hijos. Los criadores y dueños de perros utilizan esta prueba para asegurar la precisión de los registros de reproducción, confirmar y garantizar pedigrís, y proteger la integridad de la raza. Se puede encontrar más información aquí.

Array Feline 63K

El array de ADN felino Illumina Infinium iSelect 63K fue lanzado para su uso en febrero de 2011 por Morris Animal Foundation para uso de investigadores que realizan GWAS y estudios basados en arrays. En espera de la aprobación de proyectos de investigación por Morris Animal Foundation, el laboratorio de GeneSeek de Neogen es capaz de procesar muestras en esta plataforma.

Paneles y arrays personalizados

El laboratorio de operaciones GeneSeek de Neogen ha desarrollado paneles personalizados para investigación y uso comercial que han tenido mucho éxito a nivel mundial. Nos especializamos en el genotipado de alto rendimiento con respuesta rápida y nuestros expertos estarán encantados de ayudarle a seleccionar la plataforma de prueba adecuada para satisfacer sus necesidades. Si las opciones de chip para genotipado estándares no son apropiadas para sus objetivos particulares, los laboratorios GeneSeek también ofrecen los arrays personalizados Illumina Infinium BeadChips y Affymetrix Axiom, así como paneles de selección asistida por marcadores menos densos. Los ensayos pueden adaptarse a muchas necesidades específicas para el genotipado de regiones específicas, estudios de validación, estudios de asociación o programas de reproducción asistida por marcadores. También ofrecemos bioinformática, informes electrónicos y un equipo de servicio al cliente experto para traducir los datos recolectados en información práctica y útil.

Los ensayos para genotipado personalizados de GeneSeek:

  • Tan poco como 500 muestras
  • Capacidad de muestras de cientos a miles
  • Escoja entre 1-600,000 ensayos de SNP
  • Varias especies en el mismo chip
  • Tasas de éxito promedio del genotipado > 99%

Equinos

GeneSeek Genomic Profiler (GGP) Equine SNP70 BeadChip

El GGP Equine SNP70 BeadChip está disponible en GeneSeek. El BeadChip para el genotipado de SNPs equinos se basa en la plataforma del Illumina Infinium y es una de las soluciones más completas disponibles para el genotipado del genoma completo. Este BeadChip mejorado de segunda generación presenta más de 65,000 SNPs distribuidos uniformemente derivados de la colección de SNPs EquCab2.0. El BeadChip para equinos es una herramienta poderosa que permite la identificación de genes y polimorfismos que contribuyen a los rasgos de interés en todas las razas principales de caballos.

Affymetrix Equine HD array

El array HD para equinos Affymetrix de 670,000 SNP fue diseñado luego de analizar más de 2 millones de SNPs abarcando el genoma equino. Proporciona una cobertura genómica óptima de la diversidad genética conocida entre razas de caballos domésticos, maximizando la utilidad de la investigación en genética equina, incluyendo estudios de asociación del genoma completo, mapeo genético de alta resolución, mapeo Mendeliano de rasgos, análisis de diversidad y análisis de selección de firma.

SynchroGait

SynchroGait es una prueba diagnóstica de ADN basada en un proyecto de investigación que identificó una variante genética que tiene un impacto importante en el andar y la coordinación de los caballos. La prueba SynchroGait le permite identificar uno de los factores genéticos más importantes que afecta el rendimiento de un caballo trotador y que es permisivo para andares alternativos, como el paso en caballos islandeses. Se utiliza para predecir el talento y la técnica del trote entre los caballos utilizados para las carreras con arnés y el talento para los diferente andares entre ciertas razas de caballos utilizados para la equitación.

Paneles y arrays personalizados para equinos

El sistema de detección basado en espectrometría Agena MassARRAY para genotipificación sensible, precisa y rápida

  • Diseño de ensayo multiplexado fácil de usar y software de optimización ahorra tiempo de investigación y ayuda a maximizar la eficiencia
  • Los números flexibles de SNPs permiten la selección asistida por marcadores económica
  • Prueba de parentesco

Ratones

El Giga Array Universal de Genotipificación de Ratones (GigaMUGA) proporciona más de 143,000 marcadores SNP construidos en la plataforma de Illumina Infinium. El GigaMUGA mejora los 78,000 SNPs del MegaMUGA e incluye casi todo el contenido del predecesor. La mayoría de los marcadores SNP están distribuidos a lo largo del genoma del ratón y fueron seleccionados para ser informativos en la mayoría de las poblaciones de ratones, incluyendo ratones salvajes y múltiples especies de Mus, pero con un énfasis especial para los marcadores que son informativos en los recursos de población de ratones Collaborative Cross y Diversity Outbred.

Plantas

GeneSeek ofrece amplias opciones para el genotipado de plantas. GeneSeek puede realizar genotipado por secuenciación (GBS), así como el descubrimiento de SNPs para proyectos de genotipificación de plantas de todos los tamaños y especies. Con esta información de secuenciación, GeneSeek puede ayudar en el desarrollo de herramientas de genotipificación personalizadas adaptadas a sus necesidades precisas de contenido genómico de diferentes plantas. Ofrecemos servicios para cada paso de la mejora genómica para una planta de interés.

Nuestros servicios incluyen:

  • Secuenciación para el descubrimiento de SNPs
  • Bioinformática para seleccionar los mejores SNPs para estudios de asociación del genoma completo
  • Construcción de arrays de SNPs de media o alta densidad para crear modelos genómicos
  • Construcción de arrays y paneles de baja densidad para la selección asistida por marcadores
  • Uso de herramientas de diagnóstico para identificar resistencias de líneas susceptibles

Secuenciación

Genotipo especifico por secuenciación

GeneSeek utiliza tecnologías de secuenciación de nueva generación (NGS) de ADN para genotipar eficazmente objetivos específicos; de cientos a miles de marcadores genéticos pueden ser identificados de forma rápida y rentable o genotipados en grandes poblaciones usando la tecnología de genotipado por secuenciación (GBS) AmpliSeq. Los productos de GeneSeek incluyen diseño de ensayo de secuenciación enfocada personalizado, enriquecimiento por PCR múltiple, secuenciación e identificación de variantes.

Secuenciación metagenómica

Descubra la diversidad filogénica de la microbiota. La tecnología de secuenciación de nueva generación puede ser utilizada para explorar comunidades microbianas completas sin la necesidad de cultivar. Se pueden examinar varias regiones variables del gene ARNr 16S para permitir la identificación/clasificación bacteriana.

Ovejas y cabras

Las pruebas de ADN en ovejas pueden ser utilizadas para verificar el parentesco, ayudar a detectar mutaciones indeseables y ayudar a tomar las decisiones de reproducción adecuadas para el rebaño. Las pruebas genómicas que utilizan tecnologías basadas en chip también pueden usarse para desarrollar predicciones genómicas y valores de reproducción genéticamente mejorados.

Las soluciones de pruebas genómicas para ovinos de GeneSeek incluyen:

  • Mutaciones genéticas recesivas y causales
  • Selección del genoma completo
  • Determinación del mérito genético
  • Identificación de loci de carácter cuantitativo (QTL)
  • Estudios de genética comparativa

OvineSNP50 BeadChip para genotipificación

El array OvineSNP50 BeadChip presenta más de 54,241 sondas uniformemente espaciadas dirigidas a los SNPs, ofreciendo una densidad de SNP más que suficiente para estudios de asociación del genoma completo y otras aplicaciones tales como selección del genoma completo, determinación del mérito genético, identificación de loci de carácter cuantitativo y estudios de genética comparativa. El OvineSNP50 BeadChip proporciona una cobertura uniforme del genoma completo con un salto medio de 46kb.

OvineHD Array

El array OvineHD incluye más de 600,000 variantes genómicas diseñadas por el Consorcio Internacional del Genoma Ovino (ISGC). El array incluye casi todo el contenido del array original OvineSNP50. Este array de mayor densidad aumentará dramáticamente el poder para identificar genes clave responsables de los rasgos medidos deseados.

OvineLD BeadChip

El OvineLD chip incluye aproximadamente 15,000 SNPs y se utiliza para imputar con precisión hasta el array para ovinos de mayor densidad. Ademas, el chip también contiene mucho contenido genético adicional de SNPs recesivos y causales.

GoatSNP50 BeadChip

El chip GoatSNP50 utiliza más de 50,000 variantes de SNPs para proporcionar una cobertura genómica uniforme. El array fue desarrollado por el Consorcio Internacional del Genoma Caprino, quien evaluó los datos de secuenciación del genoma en las siguientes razas de cabras: Alpine, Boer, Creole, Katjang, Saanen y Savanna. Un total de 10 razas se utilizaron para validar el contenido de 52k SNPs.

Otras pruebas genéticas de ovinos disponibles:

  • Susceptibilidad al virus de neumonía progresiva ovina (OPPV)
  • Susceptibilidad a scrapie
  • Síndrome de la araña en ovinos
  • Miostatina
  • Parentesco por SNP

Paneles y arrays personalizados en ovejas y cabras

Cree arrays adaptados a sus necesidades específicas para el genotipado de regiones específicas, estudios de validación, estudios de asociación o programas de reproducción asistida por marcadores. GeneSeek ofrece los arrays personalizados Illumina Infinium BeadChips y Affymetrix Axiom, así como paneles de selección asistida por marcadores menos densos.

Porcinos

GGP para porcinos

Desarrollado a través de colaboraciones entre científicos corporativos y académicos, el GeneSeek Genomic Profiler (GGP) para porcinos incluye los 34,000 SNPs más informativos del Porcine60K, elimina los 20,000 SNPs que no tenían la mejor utilidad (bajo nivel de normatividad) en las principales razas comerciales e incluye unos 17,000 SNPs adicionales para rellenar los vacíos del cromosoma y proporcionar una mejor cobertura. Es importante señalar que el chip GGP también incluye muchos más SNPs en las regiones teloméricas del cromosoma para explicar mejor las recombinaciones que puedan ocurrir allí. El GGP Porcine BeadChip tambien incluye varios marcadores genéticos que puedan afectar directamente enfermedades o rasgos de rendimiento.

PorcineSNP60 BeadChip

El chip PorcineSNP60 presenta más de 65,000 sondas uniformemente espaciadas, ofreciendo una densidad de SNP más que suficiente para estudios de asociación del genoma completo, determinación del mérito genético, identificación de loci de carácter cuantitativo y estudios de genética comparativa.

Affymetrix Axiom, array para genotipificación de porcinos

El genotipado por array para porcinos Axiom está disponible en un formato de 96 arrays e incluye 658,692 marcadores descubiertos utilizando datos de la secuencia del genoma completo de 210 animales que abarcan una amplia gama de razas de cerdos comerciales y no comerciales que fueron seleccionados por su relevancia en programas de reproducción mundiales. El array de alta densidad ofrece el poder y la resolución para una amplia gama de aplicaciones en la reproducción de cerdos y genómica que incluyen el estudio de asociación marcador-rasgo, evaluación de líneas puras, identificar poblaciones de referencia de múltiples líneas, así como aplicaciones de investigación para el análisis genómico y estudios de análisis de barrido selectivo.

SeekGain™, programa de pruebas para rasgos de rendimiento en cerdos de GeneSeek

GeneSeek ofrece pruebas validadas de marcadores de ADN para rasgos de rendimiento en porcinos utilizando información de siete genes únicos que impactan:

  • Ingesta y conversión de alimentos
  • Aumento de peso
  • Crecimiento magro
  • Contenido de grasa
  • Calidad de la carne
  • Tamaño de la camada (receptor de estrógeno)
  • Tamaño de la camada (eritropoyetina)

Paneles y arrays personalizados para porcinos

Si las opciones de chip para genotipado estándares no son apropiadas para sus objetivos particulares, los laboratorios GeneSeek también ofrecen los arrays personalizados Illumina Infinium BeadChips y Affymetrix Axiom. Cree arrays adaptados a sus necesidades específicas para el genotipado de regiones específicas, estudios de validación, estudios de asociación o programas de reproducción asistida por marcadores.

Los ensayos para genotipado personalizados de GeneSeek:

  • Tan poco como 1,000 muestras
  • Capacidad de muestras de cientos a miles
  • Escoja entre 1,000 a 600,000 ensayos de SNP
  • Varias especies en el mismo chip
  • Tasas de éxito promedio del genotipado > 99%

Paneles y arrays personalizados

Cree arrays adaptados a sus necesidades específicas para el genotipado de regiones específicas, estudios de validación, estudios de asociación o programas de reproducción asistida por marcadores. GeneSeek ofrece los arrays personalizados Illumina Infinium BeadChips y Affymetrix Axiom, así como paneles de selección asistida por marcadores menos densos.