1. Que dados são armazenados e onde são armazenados?
    • Os dados metagenômicos 16S não são mantidos após a identificação das unidades taxonômicas operacionais. Além disso, os dados de sequência 16S fornecem informações em torno do gene 16S de cada organismo, e não o genoma completo. Os arquivos de saída são armazenados (se solicitados) para análise futura em uma análise metagenômica 16S.
  2. Cual é o tempo de resposta?
    • Os dados para a metagenômica 16S envolvem uma extração significativa do DNA, sequenciamento e processamento intensivo de dados. O tempo de resposta típico é entre 7-10 dias úteis.
  3. Cual é a diferença entre a metagenômica 16S e o sequenciamento de genoma completo?
    • A metagenômica 16S é uma análise de sequenciamento ‘específica’. Antes de adicionar amostras a um MiSeq, o gene 16S de cada organismo é amplificado. Os produtos de amplificação são então adicionados ao MiSeq. O sequenciamento do genoma completo faz uma análise de todo o DNA em um isolado.
  4. Em que tamanho deve ser enviada a amostra?
    • Nós temos recomendações sobre amostras de produtos e ambientais. O tamanho das amostras pode depender da homogeneidade do tipo de amostra, da localização do produto (trabalho em processo, matéria prima, vida útil, etc.)
  5. Como uma empresa começa com a metagenômica 16S?
    • Uma chamada de conferência rápida com um representante da Neogen ajudará uma empresa a entender elementos-chave para o projeto experimental. A continuação, uma empresa pode baixar o formulário de envio da amostra e seguir as diretrizes de amostragem fornecidas pela Neogen. Depois que as amostras são enviadas, um relatório será enviado 7-10 dias úteis após o recibimento das mesmas.
  6. A Neogen oferece recomendações e interpretações para resultados metagenômicos?
    • A Neogen pode ajudar à maioria das empresas a interpretar os resultados metagenômicos 16S. Muitas vezes, com interpretações difíceis, cientistas com doutorado estão disponíveis para situações mais complexas.
  7. As leveduras e bolores estão cobertos na metagenômica 16S?
    • Não, leveduras e bolores são eucariotas. Leveduras e bolores não possuem o gene 16S. Estes têm um gene conservado diferente chamado 18s. Os produtos do gene 16S feitos neste serviço não podem ser usados para identificação do 18s.
  8. As bactérias patogênicas são parte do perfil microbiano?
    • Não, as espécies de Listeria e Salmonella não são mencionadas nos relatórios de metagenômica 16S de deterioração. Se um estudo específico requer que essas bactérias sejam identificadas, o serviço pode denunciar esses organismos se solicitado. E. coli é identificada, mas apenas no nível da espécie (iste é, E. coli genérica).